Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LGI3Q8N145 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGI3Q8N145 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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LGI3Q8N145 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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LGI3Q8N145 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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LGI3Q8N145 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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LGI3Q8N145 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGI3Q8N145 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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