Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IFNL3Q8IZI9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IFNL3Q8IZI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFNL3Q8IZI9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
IFNL3Q8IZI9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFNL3Q8IZI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFNL3Q8IZI9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms