Protein–RNA interactions for Protein: Q86UU5

GGN, Gametogenetin, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNQ86UU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGNQ86UU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGNQ86UU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGNQ86UU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGNQ86UU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms