Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220AQ7Z4H9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM220AQ7Z4H9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM220AQ7Z4H9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms