Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT2Q7L5N7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms