Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS12Q6ZW61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS12Q6ZW61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS12Q6ZW61 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms