Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL4Q6XD76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL4Q6XD76 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL4Q6XD76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASCL4Q6XD76 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms