Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RSPO2Q6UXX9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RSPO2Q6UXX9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RSPO2Q6UXX9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RSPO2Q6UXX9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RSPO2Q6UXX9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RSPO2Q6UXX9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPO2Q6UXX9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RSPO2Q6UXX9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPO2Q6UXX9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPO2Q6UXX9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms