Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf33Q6P1S2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C3orf33Q6P1S2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf33Q6P1S2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf33Q6P1S2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C3orf33Q6P1S2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf33Q6P1S2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms