Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A4Q6P1M0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A4Q6P1M0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms