Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNRNP48Q6IEG0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNRNP48Q6IEG0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNRNP48Q6IEG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNRNP48Q6IEG0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms