Protein–RNA interactions for Protein: Q6H9L7

ISM2, Isthmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM2Q6H9L7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ISM2Q6H9L7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ISM2Q6H9L7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ISM2Q6H9L7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ISM2Q6H9L7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ISM2Q6H9L7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ISM2Q6H9L7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ISM2Q6H9L7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ISM2Q6H9L7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ISM2Q6H9L7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ISM2Q6H9L7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms