Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARL6IP4Q66PJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARL6IP4Q66PJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP4Q66PJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARL6IP4Q66PJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms