Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms