Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3AQ59EK9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3AQ59EK9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms