Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B12Q53GQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSD17B12Q53GQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSD17B12Q53GQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms