Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MICAQ29983 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MICAQ29983 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MICAQ29983 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MICAQ29983 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MICAQ29983 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MICAQ29983 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MICAQ29983 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MICAQ29983 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MICAQ29983 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICAQ29983 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICAQ29983 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICAQ29983 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICAQ29983 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICAQ29983 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MICAQ29983 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MICAQ29983 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICAQ29983 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICAQ29983 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MICAQ29983 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MICAQ29983 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MICAQ29983 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MICAQ29983 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MICAQ29983 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MICAQ29983 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MICAQ29983 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MICAQ29983 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MICAQ29983 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MICAQ29983 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICAQ29983 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MICAQ29983 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MICAQ29983 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MICAQ29983 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MICAQ29983 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICAQ29983 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICAQ29983 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICAQ29983 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICAQ29983 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICAQ29983 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICAQ29983 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MICAQ29983 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MICAQ29983 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MICAQ29983 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MICAQ29983 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MICAQ29983 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MICAQ29983 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICAQ29983 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICAQ29983 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICAQ29983 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICAQ29983 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICAQ29983 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MICAQ29983 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MICAQ29983 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MICAQ29983 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MICAQ29983 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MICAQ29983 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MICAQ29983 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MICAQ29983 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MICAQ29983 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICAQ29983 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MICAQ29983 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MICAQ29983 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MICAQ29983 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MICAQ29983 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MICAQ29983 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MICAQ29983 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICAQ29983 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICAQ29983 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MICAQ29983 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms