Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCBQ16585 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCBQ16585 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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