Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SQLEQ14534 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SQLEQ14534 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQLEQ14534 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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