Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 211.98□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AC009403.2-203ENST00000635770 2977 ntTSL 511.63□□□□□ -0.554e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 DNAJB14-201ENST00000334223 2617 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 DNAJB14-204ENST00000426476 662 ntTSL 311.14□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRR11-209ENST00000614081 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-206ENST00000444971 1508 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.765e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AC010636.2-201ENST00000595094 522 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.784e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRR11-205ENST00000580177 1641 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AC009403.2-202ENST00000636307 3956 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.824e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.884e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-209ENST00000412587 4766 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 DNAJB14-202ENST00000398991 842 ntTSL 59.26□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 MED15-209ENST00000428629 572 ntTSL 49.2□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.024e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.045e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRR11-208ENST00000582995 536 ntTSL 48.49□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-207ENST00000460309 761 ntTSL 57.96□□□□□ -1.145e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PAXBP1-209ENST00000497873 2277 ntTSL 27.92□□□□□ -1.144e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ZNF106-207ENST00000565948 3191 ntTSL 27.55□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.55□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.234e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.31□□□□□ -1.244e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-204ENST00000325960 1552 ntTSL 27.21□□□□□ -1.255e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-213ENST00000536355 571 ntTSL 47.17□□□□□ -1.265e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.265e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-205ENST00000430909 850 ntTSL 1 (best)7.17□□□□□ -1.265e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-215ENST00000446103 3256 ntTSL 27.07□□□□□ -1.284e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CAMKMT-206ENST00000428993 526 ntTSL 37.03□□□□□ -1.284e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ADNP-205ENST00000534467 773 ntTSL 37□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-212ENST00000492359 541 ntTSL 46.62□□□□□ -1.355e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-209ENST00000476198 981 ntTSL 56.55□□□□□ -1.365e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.364e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.414e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRR11-204ENST00000578777 860 ntTSL 56.02□□□□□ -1.454e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.465e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-210ENST00000479877 1855 ntTSL 25.52□□□□□ -1.535e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-208ENST00000466035 778 ntTSL 35.46□□□□□ -1.545e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PBRM1-211ENST00000423351 4385 ntTSL 55.39□□□□□ -1.554e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PRR11-206ENST00000581182 695 ntTSL 35.37□□□□□ -1.554e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AFTPH-206ENST00000487769 793 ntTSL 55.3□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AFTPH-203ENST00000409183 1874 ntTSL 25.01□□□□□ -1.614e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.734e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-215ENST00000544322 389 ntTSL 1 (best)4.08□□□□□ -1.765e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.765e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.765e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 PAXBP1-207ENST00000466846 3879 ntTSL 23.56□□□□□ -1.844e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.854e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.854e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.954e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 WDFY3-211ENST00000514071 240 ntTSL 52.88□□□□□ -1.954e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 DNAJB14-203ENST00000420137 3442 ntTSL 1 (best)2.56□□□□□ -24e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 DNAJB14-208ENST00000471101 4799 ntTSL 22.48□□□□□ -2.014e-6■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.327e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.037e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.147e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.157e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.477e-8■■■■□ 22.5
HLTFQ14527 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.448e-8■■■■□ 22.4
HLTFQ14527 WDFY3-203ENST00000426414 3428 ntTSL 27.48□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 22.4
HLTFQ14527 MPHOSPH8-201ENST00000361479 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 22.3
HLTFQ14527 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.975e-6■■■■□ 22.1
HLTFQ14527 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-7■■■■□ 22
HLTFQ14527 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 22
HLTFQ14527 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 22
HLTFQ14527 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 22
HLTFQ14527 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.296e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.256e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.186e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PEAK1-206ENST00000564328 2323 ntTSL 521.64■■□□□ 1.066e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.856e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.846e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.786e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.746e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 KAT2A-203ENST00000586972 852 ntTSL 219.55■□□□□ 0.726e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.76e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-8■■■■□ 22
HLTFQ14527 RAB4A-202ENST00000473894 708 ntTSL 317.57■□□□□ 0.46e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.36e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM95C-204ENST00000637322 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.44■□□□□ 0.226e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-8■■■■□ 22
HLTFQ14527 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 215.78■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM95C-203ENST00000637288 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.42■□□□□ 0.066e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -03e-8■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-212ENST00000556400 604 ntTSL 214.16□□□□□ -0.146e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.156e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.68□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 513.56□□□□□ -0.246e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.466e-6■■■■□ 22
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