Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCN5AQ14524 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN5AQ14524 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN5AQ14524 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN5AQ14524 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN5AQ14524 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN5AQ14524 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN5AQ14524 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN5AQ14524 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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