Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3FQ13275 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEMA3FQ13275 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA3FQ13275 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3FQ13275 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
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