Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RESTQ13127 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RESTQ13127 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RESTQ13127 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RESTQ13127 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RESTQ13127 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RESTQ13127 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RESTQ13127 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RESTQ13127 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RESTQ13127 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RESTQ13127 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RESTQ13127 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RESTQ13127 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RESTQ13127 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RESTQ13127 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RESTQ13127 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RESTQ13127 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RESTQ13127 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RESTQ13127 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RESTQ13127 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RESTQ13127 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RESTQ13127 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RESTQ13127 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RESTQ13127 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RESTQ13127 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RESTQ13127 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RESTQ13127 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RESTQ13127 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RESTQ13127 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RESTQ13127 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RESTQ13127 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RESTQ13127 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RESTQ13127 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RESTQ13127 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RESTQ13127 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RESTQ13127 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RESTQ13127 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RESTQ13127 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RESTQ13127 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RESTQ13127 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RESTQ13127 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RESTQ13127 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RESTQ13127 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RESTQ13127 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RESTQ13127 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RESTQ13127 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RESTQ13127 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RESTQ13127 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RESTQ13127 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RESTQ13127 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RESTQ13127 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RESTQ13127 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RESTQ13127 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RESTQ13127 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RESTQ13127 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RESTQ13127 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RESTQ13127 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RESTQ13127 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RESTQ13127 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RESTQ13127 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RESTQ13127 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RESTQ13127 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RESTQ13127 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RESTQ13127 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RESTQ13127 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RESTQ13127 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RESTQ13127 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RESTQ13127 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RESTQ13127 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RESTQ13127 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RESTQ13127 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RESTQ13127 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RESTQ13127 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RESTQ13127 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RESTQ13127 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RESTQ13127 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RESTQ13127 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RESTQ13127 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RESTQ13127 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RESTQ13127 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RESTQ13127 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RESTQ13127 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RESTQ13127 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RESTQ13127 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RESTQ13127 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RESTQ13127 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RESTQ13127 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RESTQ13127 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RESTQ13127 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RESTQ13127 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RESTQ13127 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RESTQ13127 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RESTQ13127 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RESTQ13127 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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