Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KRTAP1-1Q07627 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP1-1Q07627 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms