Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP4Q07065 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP4Q07065 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP4Q07065 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms