Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK18Q07002 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK18Q07002 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms