Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CALD1Q05682 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CALD1Q05682 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CALD1Q05682 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CALD1Q05682 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CALD1Q05682 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms