Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IRX3P78415 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX3P78415 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX3P78415 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX3P78415 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX3P78415 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX3P78415 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX3P78415 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX3P78415 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX3P78415 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX3P78415 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX3P78415 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX3P78415 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX3P78415 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX3P78415 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX3P78415 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX3P78415 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX3P78415 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX3P78415 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX3P78415 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX3P78415 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX3P78415 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX3P78415 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX3P78415 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX3P78415 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX3P78415 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX3P78415 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX3P78415 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX3P78415 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX3P78415 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX3P78415 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX3P78415 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX3P78415 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX3P78415 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX3P78415 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX3P78415 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX3P78415 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX3P78415 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX3P78415 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX3P78415 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX3P78415 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX3P78415 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX3P78415 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX3P78415 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX3P78415 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
IRX3P78415 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX3P78415 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX3P78415 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX3P78415 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX3P78415 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX3P78415 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX3P78415 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX3P78415 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX3P78415 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX3P78415 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX3P78415 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX3P78415 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX3P78415 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX3P78415 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX3P78415 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX3P78415 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX3P78415 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX3P78415 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX3P78415 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX3P78415 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX3P78415 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX3P78415 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX3P78415 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX3P78415 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX3P78415 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX3P78415 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX3P78415 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX3P78415 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX3P78415 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX3P78415 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX3P78415 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX3P78415 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX3P78415 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX3P78415 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX3P78415 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX3P78415 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX3P78415 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRX3P78415 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX3P78415 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX3P78415 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX3P78415 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX3P78415 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX3P78415 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRX3P78415 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX3P78415 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX3P78415 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX3P78415 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX3P78415 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX3P78415 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms