Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHC1P78364 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHC1P78364 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHC1P78364 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHC1P78364 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHC1P78364 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHC1P78364 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHC1P78364 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHC1P78364 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHC1P78364 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHC1P78364 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHC1P78364 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHC1P78364 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHC1P78364 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHC1P78364 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHC1P78364 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHC1P78364 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHC1P78364 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHC1P78364 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHC1P78364 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHC1P78364 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHC1P78364 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHC1P78364 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHC1P78364 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHC1P78364 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHC1P78364 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHC1P78364 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHC1P78364 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHC1P78364 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHC1P78364 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHC1P78364 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHC1P78364 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHC1P78364 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHC1P78364 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHC1P78364 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHC1P78364 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PHC1P78364 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHC1P78364 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHC1P78364 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHC1P78364 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHC1P78364 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHC1P78364 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHC1P78364 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHC1P78364 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHC1P78364 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHC1P78364 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHC1P78364 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHC1P78364 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHC1P78364 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHC1P78364 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHC1P78364 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHC1P78364 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHC1P78364 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHC1P78364 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHC1P78364 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHC1P78364 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHC1P78364 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHC1P78364 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHC1P78364 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHC1P78364 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHC1P78364 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHC1P78364 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHC1P78364 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms