Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1CBP62140 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1CBP62140 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP1CBP62140 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1CBP62140 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1CBP62140 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms