Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP1P59025 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP1P59025 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP1P59025 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP1P59025 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP1P59025 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP1P59025 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP1P59025 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP1P59025 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP1P59025 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP1P59025 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP1P59025 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP1P59025 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTP1P59025 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP1P59025 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP1P59025 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP1P59025 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP1P59025 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP1P59025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP1P59025 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP1P59025 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP1P59025 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP1P59025 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP1P59025 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP1P59025 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP1P59025 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP1P59025 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP1P59025 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP1P59025 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP1P59025 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP1P59025 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP1P59025 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RTP1P59025 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTP1P59025 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP1P59025 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP1P59025 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP1P59025 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP1P59025 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP1P59025 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP1P59025 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP1P59025 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTP1P59025 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP1P59025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP1P59025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTP1P59025 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTP1P59025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTP1P59025 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP1P59025 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP1P59025 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP1P59025 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP1P59025 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP1P59025 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTP1P59025 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTP1P59025 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTP1P59025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTP1P59025 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTP1P59025 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTP1P59025 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTP1P59025 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTP1P59025 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RTP1P59025 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTP1P59025 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTP1P59025 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP1P59025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP1P59025 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP1P59025 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP1P59025 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP1P59025 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP1P59025 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTP1P59025 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP1P59025 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP1P59025 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP1P59025 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP1P59025 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP1P59025 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP1P59025 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP1P59025 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP1P59025 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP1P59025 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTP1P59025 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RTP1P59025 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP1P59025 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP1P59025 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP1P59025 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP1P59025 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP1P59025 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTP1P59025 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms