Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RIPK4P57078 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RIPK4P57078 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
RIPK4P57078 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RIPK4P57078 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIPK4P57078 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms