Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD23BP54727 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD23BP54727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD23BP54727 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD23BP54727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms