Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCAN1P53805 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RCAN1P53805 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCAN1P53805 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN1P53805 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN1P53805 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms