Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLK2P49760 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLK2P49760 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLK2P49760 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLK2P49760 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLK2P49760 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLK2P49760 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLK2P49760 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLK2P49760 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLK2P49760 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLK2P49760 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLK2P49760 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLK2P49760 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLK2P49760 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLK2P49760 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLK2P49760 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLK2P49760 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLK2P49760 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLK2P49760 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLK2P49760 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLK2P49760 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLK2P49760 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLK2P49760 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLK2P49760 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLK2P49760 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLK2P49760 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLK2P49760 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLK2P49760 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLK2P49760 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLK2P49760 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLK2P49760 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLK2P49760 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLK2P49760 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLK2P49760 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLK2P49760 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLK2P49760 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLK2P49760 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLK2P49760 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLK2P49760 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLK2P49760 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLK2P49760 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLK2P49760 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLK2P49760 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLK2P49760 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLK2P49760 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLK2P49760 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLK2P49760 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLK2P49760 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLK2P49760 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLK2P49760 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLK2P49760 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CLK2P49760 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLK2P49760 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLK2P49760 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLK2P49760 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLK2P49760 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLK2P49760 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLK2P49760 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLK2P49760 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLK2P49760 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLK2P49760 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLK2P49760 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLK2P49760 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLK2P49760 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLK2P49760 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLK2P49760 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLK2P49760 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLK2P49760 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLK2P49760 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLK2P49760 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLK2P49760 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms