Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM4P49221 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM4P49221 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM4P49221 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM4P49221 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM4P49221 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM4P49221 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM4P49221 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM4P49221 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM4P49221 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM4P49221 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM4P49221 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM4P49221 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM4P49221 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM4P49221 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM4P49221 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGM4P49221 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM4P49221 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM4P49221 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM4P49221 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM4P49221 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM4P49221 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM4P49221 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM4P49221 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM4P49221 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM4P49221 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM4P49221 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM4P49221 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM4P49221 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM4P49221 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM4P49221 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM4P49221 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM4P49221 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM4P49221 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM4P49221 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM4P49221 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGM4P49221 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM4P49221 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM4P49221 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM4P49221 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM4P49221 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM4P49221 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM4P49221 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM4P49221 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM4P49221 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM4P49221 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM4P49221 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM4P49221 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM4P49221 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM4P49221 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM4P49221 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM4P49221 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM4P49221 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM4P49221 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM4P49221 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM4P49221 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM4P49221 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM4P49221 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM4P49221 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM4P49221 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TGM4P49221 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM4P49221 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM4P49221 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM4P49221 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM4P49221 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM4P49221 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM4P49221 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM4P49221 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM4P49221 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM4P49221 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM4P49221 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM4P49221 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGM4P49221 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGM4P49221 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGM4P49221 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGM4P49221 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM4P49221 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM4P49221 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM4P49221 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms