Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSL1P49006 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSL1P49006 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSL1P49006 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSL1P49006 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCKSL1P49006 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms