Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A8P48029 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A8P48029 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A8P48029 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A8P48029 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A8P48029 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A8P48029 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms