Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
RANGAP1P46060 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RANGAP1P46060 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RANGAP1P46060 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RANGAP1P46060 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RANGAP1P46060 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RANGAP1P46060 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms