Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX5P45973 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX5P45973 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX5P45973 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX5P45973 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX5P45973 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX5P45973 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX5P45973 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX5P45973 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX5P45973 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX5P45973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX5P45973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX5P45973 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX5P45973 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX5P45973 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX5P45973 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX5P45973 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX5P45973 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX5P45973 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX5P45973 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX5P45973 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX5P45973 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX5P45973 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX5P45973 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX5P45973 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX5P45973 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX5P45973 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX5P45973 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX5P45973 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX5P45973 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX5P45973 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX5P45973 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX5P45973 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CBX5P45973 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX5P45973 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX5P45973 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX5P45973 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX5P45973 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX5P45973 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX5P45973 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX5P45973 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX5P45973 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX5P45973 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX5P45973 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX5P45973 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX5P45973 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX5P45973 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX5P45973 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX5P45973 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX5P45973 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX5P45973 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX5P45973 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX5P45973 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX5P45973 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX5P45973 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX5P45973 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX5P45973 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX5P45973 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX5P45973 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX5P45973 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX5P45973 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX5P45973 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX5P45973 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX5P45973 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX5P45973 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX5P45973 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX5P45973 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX5P45973 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms