Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THPOP40225 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THPOP40225 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
THPOP40225 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THPOP40225 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
THPOP40225 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
THPOP40225 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
THPOP40225 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THPOP40225 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
THPOP40225 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
THPOP40225 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THPOP40225 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THPOP40225 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THPOP40225 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
THPOP40225 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THPOP40225 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THPOP40225 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THPOP40225 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THPOP40225 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THPOP40225 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THPOP40225 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
THPOP40225 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THPOP40225 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THPOP40225 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THPOP40225 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THPOP40225 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THPOP40225 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THPOP40225 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THPOP40225 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THPOP40225 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THPOP40225 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THPOP40225 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THPOP40225 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THPOP40225 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THPOP40225 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THPOP40225 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THPOP40225 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THPOP40225 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THPOP40225 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THPOP40225 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THPOP40225 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THPOP40225 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THPOP40225 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
THPOP40225 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THPOP40225 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THPOP40225 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THPOP40225 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THPOP40225 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
THPOP40225 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THPOP40225 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THPOP40225 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THPOP40225 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THPOP40225 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THPOP40225 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THPOP40225 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THPOP40225 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THPOP40225 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THPOP40225 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THPOP40225 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THPOP40225 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THPOP40225 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THPOP40225 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THPOP40225 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THPOP40225 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
THPOP40225 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THPOP40225 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
THPOP40225 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THPOP40225 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THPOP40225 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
THPOP40225 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THPOP40225 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
THPOP40225 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THPOP40225 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THPOP40225 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THPOP40225 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THPOP40225 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THPOP40225 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THPOP40225 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THPOP40225 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THPOP40225 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THPOP40225 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THPOP40225 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms