Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCAP28676 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCAP28676 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCAP28676 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCAP28676 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCAP28676 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCAP28676 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCAP28676 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCAP28676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCAP28676 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCAP28676 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCAP28676 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCAP28676 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCAP28676 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCAP28676 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCAP28676 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCAP28676 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCAP28676 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCAP28676 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCAP28676 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCAP28676 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCAP28676 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCAP28676 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCAP28676 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCAP28676 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCAP28676 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCAP28676 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCAP28676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCAP28676 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCAP28676 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCAP28676 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCAP28676 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCAP28676 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCAP28676 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCAP28676 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCAP28676 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCAP28676 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCAP28676 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCAP28676 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCAP28676 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCAP28676 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCAP28676 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCAP28676 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCAP28676 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCAP28676 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCAP28676 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCAP28676 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCAP28676 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCAP28676 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCAP28676 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCAP28676 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCAP28676 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCAP28676 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCAP28676 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCAP28676 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCAP28676 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCAP28676 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCAP28676 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCAP28676 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCAP28676 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCAP28676 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCAP28676 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCAP28676 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCAP28676 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCAP28676 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCAP28676 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCAP28676 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCAP28676 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCAP28676 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCAP28676 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCAP28676 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCAP28676 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCAP28676 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCAP28676 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCAP28676 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCAP28676 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCAP28676 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms