Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPL13P26373 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPL13P26373 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPL13P26373 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPL13P26373 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPL13P26373 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPL13P26373 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPL13P26373 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPL13P26373 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPL13P26373 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPL13P26373 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
RPL13P26373 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPL13P26373 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPL13P26373 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPL13P26373 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPL13P26373 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RPL13P26373 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPL13P26373 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPL13P26373 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPL13P26373 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPL13P26373 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPL13P26373 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPL13P26373 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPL13P26373 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPL13P26373 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPL13P26373 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL13P26373 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL13P26373 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL13P26373 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL13P26373 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPL13P26373 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPL13P26373 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPL13P26373 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPL13P26373 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPL13P26373 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPL13P26373 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPL13P26373 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL13P26373 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL13P26373 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL13P26373 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL13P26373 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPL13P26373 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPL13P26373 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPL13P26373 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPL13P26373 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPL13P26373 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPL13P26373 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPL13P26373 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPL13P26373 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPL13P26373 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPL13P26373 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPL13P26373 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL13P26373 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPL13P26373 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPL13P26373 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL13P26373 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL13P26373 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL13P26373 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL13P26373 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPL13P26373 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPL13P26373 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPL13P26373 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL13P26373 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL13P26373 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL13P26373 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL13P26373 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL13P26373 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL13P26373 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL13P26373 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms