Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME2P23368 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME2P23368 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME2P23368 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME2P23368 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ME2P23368 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ME2P23368 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME2P23368 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME2P23368 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME2P23368 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME2P23368 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME2P23368 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ME2P23368 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME2P23368 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME2P23368 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME2P23368 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME2P23368 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ME2P23368 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME2P23368 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME2P23368 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME2P23368 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME2P23368 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME2P23368 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME2P23368 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME2P23368 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME2P23368 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME2P23368 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME2P23368 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME2P23368 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME2P23368 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME2P23368 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME2P23368 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME2P23368 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME2P23368 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME2P23368 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME2P23368 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME2P23368 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME2P23368 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME2P23368 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ME2P23368 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ME2P23368 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ME2P23368 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ME2P23368 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME2P23368 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME2P23368 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ME2P23368 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME2P23368 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME2P23368 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ME2P23368 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME2P23368 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME2P23368 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME2P23368 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME2P23368 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ME2P23368 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME2P23368 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME2P23368 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME2P23368 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ME2P23368 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME2P23368 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME2P23368 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME2P23368 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME2P23368 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME2P23368 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME2P23368 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME2P23368 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME2P23368 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME2P23368 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME2P23368 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME2P23368 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME2P23368 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME2P23368 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME2P23368 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME2P23368 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME2P23368 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME2P23368 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME2P23368 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME2P23368 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME2P23368 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME2P23368 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME2P23368 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME2P23368 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME2P23368 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms