Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BGNP21810 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BGNP21810 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BGNP21810 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BGNP21810 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BGNP21810 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BGNP21810 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BGNP21810 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BGNP21810 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BGNP21810 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BGNP21810 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BGNP21810 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BGNP21810 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BGNP21810 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BGNP21810 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BGNP21810 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BGNP21810 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BGNP21810 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BGNP21810 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BGNP21810 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BGNP21810 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BGNP21810 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BGNP21810 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BGNP21810 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BGNP21810 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BGNP21810 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BGNP21810 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BGNP21810 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BGNP21810 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BGNP21810 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BGNP21810 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms