Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT15P19012 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT15P19012 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT15P19012 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT15P19012 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT15P19012 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT15P19012 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT15P19012 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT15P19012 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT15P19012 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT15P19012 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT15P19012 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT15P19012 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT15P19012 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT15P19012 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT15P19012 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT15P19012 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT15P19012 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT15P19012 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT15P19012 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT15P19012 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT15P19012 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT15P19012 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT15P19012 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT15P19012 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT15P19012 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT15P19012 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT15P19012 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT15P19012 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT15P19012 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT15P19012 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT15P19012 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT15P19012 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT15P19012 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT15P19012 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT15P19012 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT15P19012 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT15P19012 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT15P19012 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT15P19012 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT15P19012 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT15P19012 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT15P19012 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT15P19012 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT15P19012 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT15P19012 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT15P19012 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT15P19012 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT15P19012 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT15P19012 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT15P19012 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT15P19012 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT15P19012 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT15P19012 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT15P19012 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT15P19012 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT15P19012 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT15P19012 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT15P19012 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT15P19012 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT15P19012 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT15P19012 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT15P19012 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT15P19012 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT15P19012 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT15P19012 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT15P19012 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT15P19012 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT15P19012 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT15P19012 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT15P19012 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT15P19012 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT15P19012 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT15P19012 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT15P19012 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT15P19012 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT15P19012 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT15P19012 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT15P19012 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT15P19012 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT15P19012 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT15P19012 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT15P19012 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT15P19012 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT15P19012 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms