Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB9P17482 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB9P17482 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB9P17482 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms