Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX1P15863 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX1P15863 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX1P15863 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX1P15863 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX1P15863 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX1P15863 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX1P15863 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX1P15863 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX1P15863 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX1P15863 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX1P15863 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX1P15863 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX1P15863 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX1P15863 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX1P15863 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX1P15863 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX1P15863 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX1P15863 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX1P15863 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX1P15863 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX1P15863 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX1P15863 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX1P15863 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX1P15863 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX1P15863 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX1P15863 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX1P15863 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX1P15863 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX1P15863 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX1P15863 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX1P15863 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX1P15863 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX1P15863 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX1P15863 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX1P15863 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX1P15863 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX1P15863 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX1P15863 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX1P15863 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX1P15863 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX1P15863 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX1P15863 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX1P15863 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX1P15863 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX1P15863 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX1P15863 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX1P15863 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX1P15863 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX1P15863 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX1P15863 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX1P15863 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX1P15863 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX1P15863 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX1P15863 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX1P15863 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX1P15863 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX1P15863 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAX1P15863 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX1P15863 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAX1P15863 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PAX1P15863 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX1P15863 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAX1P15863 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms