Protein–RNA interactions for Protein: P10721

KIT, Mast/stem cell growth factor receptor Kit, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KITP10721 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KITP10721 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KITP10721 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KITP10721 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KITP10721 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KITP10721 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KITP10721 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KITP10721 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KITP10721 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KITP10721 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KITP10721 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KITP10721 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KITP10721 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KITP10721 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KITP10721 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KITP10721 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KITP10721 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KITP10721 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KITP10721 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KITP10721 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KITP10721 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KITP10721 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KITP10721 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KITP10721 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KITP10721 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KITP10721 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KITP10721 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KITP10721 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KITP10721 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KITP10721 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KITP10721 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KITP10721 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KITP10721 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KITP10721 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KITP10721 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KITP10721 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KITP10721 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KITP10721 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KITP10721 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KITP10721 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KITP10721 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KITP10721 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KITP10721 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KITP10721 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KITP10721 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KITP10721 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KITP10721 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KITP10721 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KITP10721 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KITP10721 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KITP10721 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KITP10721 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KITP10721 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KITP10721 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KITP10721 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KITP10721 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KITP10721 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KITP10721 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KITP10721 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KITP10721 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KITP10721 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KITP10721 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KITP10721 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KITP10721 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KITP10721 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KITP10721 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KITP10721 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KITP10721 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KITP10721 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KITP10721 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KITP10721 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KITP10721 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KITP10721 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KITP10721 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KITP10721 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KITP10721 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KITP10721 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KITP10721 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KITP10721 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KITP10721 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 925.9 ms