Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPH10BP0C881 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH10BP0C881 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH10BP0C881 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RSPH10BP0C881 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms